Το Μουσείο Ναυπηγικών και Ναυτικών Τεχνών του Αιγαίου αποτελεί ένα θεματικό τεχνικό μουσείο βασισμένο πάνω στις ιδέες της νέας μουσειολογίας. Έχει σχεδιαστεί για να εκπληρώσει τους στόχους του μέσα από ένα πλέγμα μουσειακών, εκπαιδευτικών και ερευνητικών δραστηριοτήτων που συνδέονται λειτουργικά και αλληλοσυμπληρώνονται. Στο επίκεντρο του νέου Μουσείου βρίσκεται τόσο η διάσωση και η αξιοποίηση της υλικής όσο και η διαφύλαξη και προβολή της άυλης πολιτιστικής κληρονομιάς στους τομείς της ναυπηγικής και ναυτικής τέχνης του Αιγαίου.