Η έκθεση της λαογραφικής συλλογής λειτουργεί σε ένα παραδοσιακό κτίσμα στο χωριό Πορτιανού της Λήμνου. Το κτίριο είναι χαρακτηρισμένο διατηρητέο μνημείο και αποτελεί αντιπροσωπευτικό δείγμα της λαϊκής αρχιτεκτονικής του νησιού της Λήμνου.
Η συλλογή του Μουσείου αναδιοργανώθηκε και επανασχεδιάστηκε με τρόπο που γεφυρώνει τη λαογραφική παράδοση με σύγχρονη σχεδιαστική προσέγγιση.